脑干梗塞原因包括：长期的抽烟、饮酒，损害脑血管，糖尿病患者血糖控制长期不理想以及随着患者年龄的增长，高血压、冠心病等疾病均会导致和加重脑动脉硬化的程度。

脑动脉逐渐形成斑块导致血管狭窄。同时患者在高血压、糖尿病等危险因素的不良作用下，脑动脉硬化不断加重，达到一定程度会导致动脉狭窄，管腔内逐渐形成斑块。

通常通过合理的治疗，如果是稳定斑块，常常不引起脑梗死；如果是不稳定斑块最终因斑块突然脱落，阻塞血管，导致脑干梗塞。