宝宝有房间隔缺损，可以注射疫苗。房间隔缺损是一种比较常见的先天性心脏病，这种宝宝的抵抗力可能比正常的宝宝还要低，更容易患各种感染。

所以，给宝宝注射疫苗可以有效地预防相关的传染病，对宝宝的健康是有帮助的，而且注射疫苗并不会影响患者的房间隔缺损治疗，也不会使这种先天性心脏病的病情加重，所以可以注射疫苗。

当然，注射疫苗时一定要注意选择宝宝在身体状况比较好的情况下，不能有发烧或者上呼吸道感染等方面的问题。只要在宝宝正常的情况下，可以按时注射相关的疫苗。