若附睾畸形的患者畸形程度比较轻的情况下，则对生育无明显影响。若畸形较为严重，则可能发生附睾闭锁或缺如，临床检查多表现为无精症，对患者生育产生影响。

临床中，若为附睾或者是输精管的缺如可通过外科手术取经治疗，若为附睾阶段性的闭锁，则可通过吻合手术治疗，将输精管与通畅的附睾相连接，使精子进入睾丸、附睾，进而通过输精管参与正常的射精过程，这就是附睾畸形的治疗的大体情况。