肠瘘治疗效果不好或者治疗周期较长时，会引起比较多的后遗症及并发症。

肠瘘是指肠道出现了与其他部位的异常通道，导致肠内容物溢出，可以引起感染及营养不良等临床症状，通常是由于肠道外伤、肠道术后切口感染、肠道炎症以及恶性肿瘤等疾病引起。怀疑肠瘘时，需要行腹部CT、血常规及生化等辅助检查，判断肠瘘的严重程度，结合患者临床症状制定相应的治疗方案。

如果肠瘘治疗周期较长，由于反复的炎症发作以及营养不良，会导致患者出现粘连性的肠梗阻，以及其它器官的功能障碍等并发症及后遗症。