龟头旁边长水疱，多考虑可能为生殖器疱疹所致。该病主要是由于疱疹病毒感染所引起，属于一种性传播疾病，通常是由于存在不洁的性行为，导致感染疱疹病毒所致。该病刚刚发作时可在龟头、生殖器周围以及冠状沟等部位出现簇状分布的小红点，并逐渐形成水疱，应积极进行抗病毒治疗。

也可能为龟头炎所致，由于受到细菌、真菌或滴虫等病原菌感染，导致龟头局部产生炎症反应。由于炎症的刺激作用，可使龟头局部出现水疱，还可伴有明显的红斑以及瘙痒和疼痛症状。

应及时明确病原菌的类型，对症选择敏感类抗生素予以治疗，促进炎症消退。