鳃裂囊肿和瘘管的危害有会导致患者的面颈部侧方出现肿块，并出现流脓的瘘口，如果不进行及早的治疗，囊肿就会穿破皮肤引起感染，不但会影响患者的容貌，而且还可能会导致患者出现发热等全身反应，严重的甚至会发生癌变。

鳃裂囊肿和瘘管主要是由于在胚胎发育过程中，鳃裂没有完全消失，导致上皮组织残留而引起的，需要及早到医院进行手术治疗。

手术治疗的方法主要有鳃裂囊肿摘除术以及鳃裂瘘切除术，大部分患者经过正规的治疗后，都可治愈，预后也比较好。