肛门里面隐约痛，首先需要进行局部的检查，在诊断明确以后，可以进行药物治疗或者是手术治疗。

如果是由于肛窦炎、直肠炎、肛柱发炎等因素所引起，可以先进行药物的对症治疗，可以采用中药进行保留灌肠，同时配合清热利湿、消炎镇痛的药膏和药栓肛门内塞入。同时还可以口服头孢类的抗生素药物，进行对症的治疗。如果肛窦炎有脓液形成，并且有肛瘘发生，可以考虑切开引流。

如果是由于肛管直肠间隙的脓肿，或者是直肠黏膜下脓肿所引起，需要通过手术进行治疗。手术以后也要注意多休息、按时换药。

肛门里面隐约痛，首先是到肛肠科通过肛门指检、肛门镜的检查进行初步的判断。必要时进一步地做直肠内的超声检查，或者是电子纤维结肠镜的检查，还可以考虑进行肛周磁共振的检查。