由于卵巢囊肿的具体性质不同，所以引起卵巢囊肿的原因，因人而异。比如是普通的卵巢囊肿，很可能是卵巢分泌的雌孕激素刺激导致。

但如果女性是卵巢巧克力囊肿，常常是因为子宫内膜异位到卵巢上导致。可能是月经期同房引起，也有可能是因为女性行腹腔手术导致，比如行剖宫产手术。

但如果是炎性卵巢囊肿，则是盆腔炎症刺激导致，这类女性常会有下腹部持续疼痛的症状。在发现后，一般需要使用抗生素进行对应的抗炎治疗。