引起炎症性肠病关节炎的确切病因目前尚不完全明确，但是经多年来的研究发现，疾病的发生是跟自身免疫功能紊乱、遗传因素、环境因素、感染因素等有关。

当然长期生活不规律、饮食不当、大量吸烟或者口服避孕药等也是有可能诱发疾病发生，所以疾病的发生往往是多因素共同作用的结果。

炎症性肠病关节炎是一种慢性自身免疫性疾病，不仅会累及到关节出现病变，也会引起全身的症状表现，尤其是肠道病变、皮肤粘膜的损害，以及炎症性的眼病等。