新生儿隐睾的原因主要有以下几点：

1.遗传因素。此病有明显的家族遗传倾向，如果家族当中有此类患者，患儿发病率相对就会比较高。

2.内分泌因素。比如调控睾酮分泌的中枢神经系统功能出现问题，就会造成睾丸下降障碍，从而出现隐睾。

3.睾丸自身因素的问题。比如睾丸结构异常，在胚胎期原始性腺分化出现问题，导致两边睾丸融合成一个睾丸，就会阻碍睾丸沿正常途径下降。

4.精索血管异常。比如精索血管发育出现延迟或者停止发育，导致精索过短，也会引发此病。