脑干先兆性偏头痛在以前也被称为是基底型偏头痛。

在女童和青春发育期的女孩中多见，其发作规律可能与月经有关联。脑干先兆性偏头痛最大特点是具有头痛前的先兆症状，如视觉突然出现的暗点、闪光以及黒蒙等症状。 这些症状通常在头痛发生前约20至30分钟出现，有时可持续约数小时才消失。

此外，患者也会发生一些脑干的临床症状，如双侧肢体的麻木无力、意识改变、共济失调以及不自主的跌倒等。患者一旦出现这些症状需要到正规医院神经内科行辅助检查，以免延误病情。