克山病的病因目前尚不清楚。克山病指的是一种地方性的心肌疾病，这种心肌病号发于我国的黑龙江省克山县，因此，把这种新疾病称之为客克山病。目前克山病的发病原因，认为可能和以下方面的因素有关系：

第一，地理因素，可能和当地的饮食中化学物质，比如硒和镁等的缺乏有关系。

第二，病毒感染，比如有研究显示，克山病死亡患者的心肌中以及血清中，往往可以检测出柯萨奇病毒，并且这种病毒会引起实验老鼠出现类似克山病的病理改变。

因此，目前认为克山病的发病，可能和缺硒以及柯萨奇病毒感染等多种因素作用下引起。