怀孕期间上厕所流血的原因要分为小便时出血和大便时出血。

小便时出血有可能出现了泌尿系统感染，而导致肉眼血尿，还有可能出现泌尿系统结石的情况。可以通过泌尿系统的B超以及尿常规检测的方式进行明确。而大便时出血多是由于痔疮所引起的，在怀孕期间由于增大子宫的压迫，胃肠道功能减弱，都有可能导致痔疮的加重，继而引起大便时出血的情况发生。

对于怀孕期间大小便时出血，需要进行适当治疗。对于小便时的出血，主要以药物治疗为主。而对于大便时的出血，需要进行适当饮食调理以及药物治疗，必要时还可以在怀孕中晚期通过手术治疗的方式处理痔疮。