靶向药物吃3年如果有效一般情况下是不可以停药的，只有患者不能耐受药物副作用或者疾病出现进展才能停药。

因为靶向药物目前主要用于晚期恶性肿瘤的治疗。晚期恶性肿瘤服用靶向药物后3年，如果疾病稳定，靶向药物是建议继续维持用药的，以保证恶性肿瘤始终处于稳定不发展的状态。一旦停药，很可能会导致恶性肿瘤继续发生病变的播散，从而导致生存时间的缩短。

如果靶向药物吃了3年后，副作用太大不能耐受或者靶向药物耐药使肿瘤出现进展，以上情况都需要停用药物，同时换用化疗等其他的抗肿瘤治疗手段。