长期高血脂主要损害的是全身大、中、小动脉和肝脏，具体如下：

1.各个动脉在高血脂环境下会出现内皮损伤，导致斑块形成，造成动脉粥样硬化，血管脆性增加，造成所滋养的器官缺血缺氧，长期发展，导致局部器官的功能减退。如果斑块破裂出血，还会形成血栓，造成局部器官梗死，比如脑梗死、急性心肌梗死等。

2.肝脏是代谢脂肪的主要器官，长期高脂血症造成肝脏长期高负荷工作，当超过肝脏代谢能力的时候出现肝细胞损伤，造成脂质在肝脏沉积，出现脂肪肝，严重者进一步发展为肝炎及肝硬化。