长期使用滴眼液对身体是否有副作用，应根据患者的病情需要，权衡利弊。但在选择眼药水时应选择不含防腐剂的药物。

若长期使用含有防腐剂的眼液，可能导致眼表和泪膜的损害，加重或者引起干眼症。若为青光眼患者需长期使用降眼压的药物，以免高眼压导致视神经不可逆性损害，权衡利弊，需继续用药。

但若只是普通的结膜炎，不需要长期使用滴眼液，多数眼液都含有防腐剂，长期使用容易导致细菌耐药，对患者有害无益。