三个月的婴儿发生了鹅口疮的时候，可以使用一些药物治疗。

可以将制霉菌溶液涂抹于口腔内，这样就可以治疗鹅口疮所引起的不适。在发生这种疾病之后，还可以给孩子补充维生素B2和维生素C，这样也有助于病情的控制与缓解。

三个月的婴儿在患上这种疾病的时候，一般是不需要使用一些抗菌药物进行治疗的。这个时候不能滥用药物，否则会影响孩子的健康。在治疗的同时，一定要给婴儿的奶瓶，以及餐具进行严格的消毒措施。要给患儿勤洗澡、勤换洗衣服，保持皮肤的清洁与卫生。