小儿尿路感染结合临床有尿频、尿急、尿痛等尿路刺激征表现，以及实验室尿培养细菌学检查可确诊。

婴幼儿症状可不典型，常以发热为最突出表现，所以不明原因发热患儿也需要完善尿液检查。查尿沉渣白细胞＞10每高倍镜，或者1小时尿白细胞排泄率测定，白细胞数＞30万，要怀疑尿路感染。

怀疑尿路感染者，查尿细菌培养及菌落计数，当中断尿培养菌落≥10万/mL可确诊。诊断此病还要注意，尿液标本要在使用抗生素前留取，培养结果还要综合细菌种类，以及繁殖力综合判断。