生理性飞蚊症和病理性飞蚊症的区别在于其发病原因的不同以及临床表现不同。

生理性飞蚊症的发生原因可能与患者的年龄、屈光不正等有关，这种情况多见于老年患者以及高度近视的患者。

病理性飞蚊症的发生于多种眼病有关，比如玻璃体炎、葡萄膜炎等；并且病理性玻璃体混浊临床症状相对于生理性玻璃体混浊的患者，其眼前的黑影更大、更多、更影响患者的视力；并且病理性玻璃体混浊的患者发生视网膜脱离、眼底出血的几率更高。