乙状结肠镜检查最好能够避开月经期。

因为女性在月经期时，生殖系统的抗感染能力会降低。而乙状结肠镜在检查前需要进行肠道准备，大多采取清洁灌肠的方式进行肠道准备，会导致患者排便次数增多，会增加粪便污染患者会阴的概率，从而有导致生殖系统感染的可能。

检查时乙状结肠镜需要从患者肛门进入，所以在检查的过程中也有可能会污染会阴区域。而女性如果月经量比较大时，也会增加会阴以及肛门周围护理的难度，患者需要等月经结束后再进行乙状结肠镜检查。