宝宝长期咳嗽，可以进行以下几种检查：

一、支气管镜。判断咳嗽是否因为喉咙内有异物存在，对咽喉造成刺激所引起的，以及判断是否有气道发育畸形或痰液栓塞等情况。

二、病原学检查。如果因呼吸道感染导致咳嗽，通过病原学检查，能够明确致病菌的类型，例如支原体、细菌、病毒等。根据致病菌对症治疗，效果较好。

三、过敏原检查。如果因过敏性咳嗽导致长期咳嗽，及时查找过敏原，在生活中脱离过敏原，预防咳嗽的发生。

四、胸部CT。观察胸部是否有病变，如果咳嗽长时间存在，容易对肺部造成影响。