因为人体肛周的神经分布较为丰富而且敏感，肛裂、痔疮、肛门直肠感染这些肛肠疾病，都会导致肛周出现刺痛的症状。尤其是肛裂，在排大便的时候用力过度，撕裂肛周组织出现裂口，在排便时会剧烈疼痛，排便过后由于裂口还没有愈合，也会导致有刺痛的感觉。

痔疮与平时饮食有关，经常便秘导致大便干燥，粪便堵在肛门口，再用力排便时痔疮受到挤压而引起刺痛感，特别存在有炎症时，炎症因子刺激肛门部位刺痛尤为明显。

肛门直肠部位出现感染，比如肛窦炎、肛管炎，刺激肛门的神经也会引起刺痛。