肛门息肉切除后会有疼痛，但多数患者疼痛比较轻微，也不需要特殊的镇痛治疗。

因为肛门息肉是生长于肛管皮肤表面或者是齿状线处，而且生长的部位是受脊神经支配，所以对手术切割会产生疼痛。但由于肛门息肉手术创面相对比较小，所以产生的疼痛也不会很剧烈。

对于疼痛比较明显的患者，可以在术后使用复方角菜酸酯栓塞肛门，必要时可以口服止痛类的药物控制疼痛。术后患者还要注意保持排便通畅，因为大便干燥摩擦手术创面会加重疼痛症状。