小儿癫痫的病因有先天性脑畸形、出生损伤、营养代谢疾病等，小儿癫痫的病因较为复杂。

先天性脑畸形可增加癫痫的发病率，小儿癫痫会明显损害儿童的健康，甚至导致更危险的病。出生损伤是小儿癫痫的常见原因，生产时间过长会对孩子的大脑造成损害，胎儿大小或胎儿位置的异常可导致新生儿大脑受损，从而增加小儿癫痫的发病率。

大脑发育迟缓会增加儿童癫痫的发病率，脑萎缩或脑膜炎可导致儿童癫痫，要早期发现，早期治疗。