慢性血吸虫病在流行区占绝大数，在急性症状消退而未经治疗或疫区反复轻度感染，而获得部分免疫力者，病程经过半年以上，称慢性的血吸虫病，病程可长达10~20年甚至更长。

临床表现以隐匿性、间质性肝炎或慢性血吸虫性结肠炎为主，可分为无症状型和有症状型。患有慢性血吸虫病之后还会有肝脾肿大的症状，这种症状主要以肝肿大为主。严重还会逐渐的发展成为肝纤维化，甚至是发展成为肝硬化。

慢性血吸虫病治疗以吡喹酮为首选药物，吡喹酮为一广谱抗蠕虫药，是一种安全、有效、使用方便的治疗药物。对晚期患者常在接受中药的调理后，再做杀虫治疗或者是外科手术治疗。