男性尿道口长息肉首先要明确息肉的性质，因为不同性质的息肉治疗方式是不一样的，所以先要将息肉完整切除，将切除的组织送去行病理检查，明确诊断。

如果息肉为普通的疣或者是尿道口的囊肿，切除之后不需要再行其它的治疗。如果息肉是尖锐湿疣，属于性传播疾病，在手术切除以后，还需要行抗病毒治疗，同时在治疗期间要禁止性生活。

如果息肉的性质为恶性肿瘤，需要根据肿瘤的恶性程度和临床经验，来决定手术的扩大切除范围，进一步给予相关治疗。