新生儿肺炎三天以后发病，可能是由于在生产过程中出现一些差错，或者孩子在出生后由于被护理不当以及孩子的相关身体发育不完善等原因造成。

可能是由于在进行分娩的过程中，由于受到了一些不正确的护理而导致孩子感染了病毒，从而引起肺炎的发生；也有可能是由于孩子在出生以后，接触到了感染病毒的一些患者，新生儿由于抵抗力较差，从而导致肺炎的发生。

也有可能是孩子在出生后相关的一些调节功能并不完善，导致在子宫内吞向了母亲的羊水，从而感染一些病毒，进而引起了肺炎。