肝胆管结石和肝囊肿都属于良性病变，本身不会发生癌变。

但是肝胆管结石可以长期刺激胆道组织，造成组织损伤或诱发炎症，引起细胞不断的分化和增殖。这个过程如果长期保持就有可能引起癌变，这种情况下建议尽早治疗。

目前临床上并没有发现肝囊肿癌变的病例，肝囊肿在临床治疗过程中主要是预防囊内感染和囊肿破裂。如果肝囊肿引起的症状比较大，需要手术治疗。

肝胆管结石和肝囊肿性质不一样，所以发生的几率也不同。