5个月的宝宝秋季老是腹泻，要根据其病因进行对因对症止泻治疗：

1.如果是脾胃虚弱引起的腹泻，可以给宝宝服用醒来养脾颗粒、布拉氏酵母菌调节脾胃功能，逐渐改善腹泻的症状。

2.对于病毒感染引起的秋季腹泻，比如诺如病毒、轮状病毒，可给予蒙脱石散、益生菌等药物止泻治疗，补充补液盐补充体内的水分。

3.对于细菌感染引起的腹泻，只需要给予消炎药治疗，比如阿莫西林克拉维酸钾，头孢克洛颗粒控制，炎症结合应用，蒙脱石散益生菌等药物治疗，严重时要静脉输液治疗，防止出现脱水。