肛门流脓首先就是要到正规医疗机构的肛肠科进行就诊，一般是考虑发生了肛门周围的脓肿或者是有肛瘘的情况，是属于肛门周围感染化脓性的疾病。一般都是和细菌的感染有一定的关联，肛门周围的软组织在受到细菌感染以后会发生坏死液化，最后有脓液的形成。

如果是肛门周围的脓肿或者是肛瘘的情况，主要的治疗方法是通过手术进行治疗，单纯的通过药物治疗效果并不理想。肛周脓肿和肛瘘在手术以后是属于开放性的创面，所以一定要按时进行换药，保持手术创面引流的通畅，保持肉芽组织的新鲜，促进伤口的愈合。

在排便以后可以使用中药制剂进行局部的坐浴和清洗，既可以保持局部的清洁，还可以起到止疼的效果，促进伤口的愈合。