军团菌肺炎和肺结核有以下区别。首先两者感染的致病原不同，军团菌肺炎是由军团菌感染引起的肺炎 。虽然它有一定的传染性，但它并不属于传染病，并不需要隔离治疗。肺结核是由结核分枝杆菌感染引起，属于乙类传染病。

其次临床症状也有不同。军团菌肺炎多是以干咳为主，可伴有发热，部分患者还可以伴有肺外的临床表现。肺结核主要是结核的中毒症状，伴有咳嗽、咳血、胸痛、咳痰等表现，病情轻重不一。

诊断军团菌肺炎多需要完善胸片，以及军团菌特异性的抗原检测。肺结核多需要完善相应的病原学检查，找到有结核分枝杆菌存在的依据或病理诊断。治疗上也有区别，军团菌肺炎需要使用氟喹诺酮类、大环内酯类消炎药抗感染治疗。肺结核需要使用抗结核药物，规范足疗程的治疗。