早上醒来手指关节僵硬、疼痛，考虑以下几种可能的情况：

1.免疫系统疾病。如风湿或类风湿性关节炎，因为在夜间睡眠的状态下手指关节活动较少，而风湿或类风湿性关节炎会导致关节中的炎性因子渗出，使关节出现渗出物的沉积。所以，在早上醒来会出现关节僵硬疼痛的表现。

2.腱鞘炎。手指腱鞘炎多为手指关节的劳损及退行性病变，其在腱鞘上出现炎性渗出。由于夜间炎性物质蓄积在手指关节处，导致早上醒来手指关节僵硬、疼痛不适，需要予患者非甾体类药物对症治疗，可缓解症状。