早上咳黄痰主要考虑是呼吸道存在细菌感染，常见疾病包括肺炎、支气管炎、支气管扩张合并感染。

如果因熬夜、淋雨、受凉等因素诱发免疫力低下，此时很容易受到细菌侵袭而引起呼吸道感染。在夜间睡觉时呼吸道会产生大量分泌物，气道当中不断蓄积痰液。所以早上起床时咽部会不断受到刺激，从而表现为咳脓黄痰。

另外，部分患者早上咳黄痰是由鼻炎、鼻窦炎引起。鼻腔存在炎症便会引起炎症分泌物形成，夜间睡觉时会出现倒流现象，流入咽部时便容易导致早上咳黄痰。