新型冠状病毒主要侵犯呼吸道，因此新型冠状病毒核酸检测主要是在咽拭子、鼻拭子、痰液和其他下呼吸道分泌物等采集标本。

检测下呼吸道标本，比如痰或气道抽取物更加准确。患者外周血液、粪便、尿液等标本中，也可检测出新型冠状病毒核酸。

核酸检测会受到标本采集时间、检测过程、检测试剂灵敏度等因素的影响，为提高新型冠状病毒核酸检测阳性率，应规范采集标本，标本采集后应尽快送检。