一般汉坦病毒引起的智力障碍是预后不良的。汉坦病毒引起的脑损害，一般发生在低血压休克期。一般出现在发病的4~6日，有一些迟者可能会发生在发病的8~9日出现。

严重者血压持续下降，血容量持续下降，出现脸色苍白、四肢厥冷、脉搏细弱，或者是不能触及。当大脑供血不足的时候，可以出现烦躁、谵妄、神志恍惚，有的人可能会影响到智力，长期的组织缺氧可以引起大脑细胞不可逆的损害。

这种损害如果影响到智力的话，智力也是不会恢复的，更严重者可能发生DIC从而危及生命。