战壕热的病原微生物是五日热立克次体，虱子叮咬主要传播途径，同时可从消化道、呼吸道接触传播。

携带立克次体的虱子叮咬正常人群后，病原微生物会进入人体，进一步侵犯血管内皮细胞和红细胞，引起菌血症症状。

同时如果正常人群生活在战壕热发病密集地区，周围环境容易被污染。如果通过呼吸道以及消化道方式接触较高浓度感染病原微生物，可以通过呼吸道及消化道方式侵犯人体导致发病，一般建议在流行地区注意自身卫生工作。