双侧基底节腔隙性脑梗死是脑梗死的一种，主要因为脑血管里边的深穿支小血管狭窄、闭塞引起。治疗上首选阿司匹林、氯吡格雷等药物抗血小板聚集，阿托伐他汀钙、瑞舒伐他汀钙软化血管，稳定斑块。

若是急性期脑梗死，还可以采用静脉输注液体治疗，比如活血化瘀的药物，如血栓通等，大多数患者有高血压、糖尿病基础病。

对于发生双侧基底节腔隙性脑梗死的患者，建议患者积极控制血压、血糖、血脂、血清同型半胱氨酸，预防小血管病变，同时注意饮食，加强运动，定期监测血压、血糖。