小柴胡颗粒和板蓝根的主要区别，在药性方面以及适应证方面有所不同。

小柴胡颗粒主要有解表散热的功效，并兼具舒肝和胃的作用，临床上常用于治疗外感症，比如风热感冒所引起的多种不良症状，适用本药物治疗。而板蓝根颗粒的主要功效是凉血利咽，并可清热解毒，对于肺部和胃部热盛所引起的咽干口燥、喉咙肿痛有不错的治疗效果。临床上常用于对急性的扁桃体炎、腮腺炎等这类病症的治疗。

以上就是小柴胡颗粒和板蓝根的主要区别，患者在使用这类药物时，最好应咨询医生或者专业药师，以做到准确用药。