肛瘘不是肛周脓肿，而是肛周脓肿的后遗症。

其病理发展是肛窦、肛门腺感染，感染灶沿着肛门直肠周围间隙或者淋巴管蔓延，形成肛门直肠周围脓肿。在脓肿自行破溃或者手术切开引流后，脓腔随着大量脓液排出，压力减小，脓腔和周围大量结缔组织增生。因为肛窦炎和肛门腺炎未得到及时治疗，脓肿内口炎症持续存在，致使粪便残渣和脓性分泌物自外口排出，经久不愈形成肛瘘。

所以，肛周脓肿是肛瘘的一个主要病理阶段，可分为急性期和慢性期。