肛瘘的手术不仅是把外口及瘘管处的烂肉挖掉，还要将内口准确找到，并进行挂线处理，这样肛瘘才能得到彻底治愈，术后不会复发。

所以有的患者不理解，为什么术区会有一个橡皮筋，因为橡皮筋是挂在内口处的，将内口勒断后形成新的创面，肉芽组织才会快速增长，使内口愈合，从而在根本上治愈肛瘘。

肛瘘手术中挖烂肉时要注意保护好肛门括约肌，以防将肛门括约肌切断导致肛门不完全失禁，甚至是完全失禁的严重后果。