刚怀孕发现卵巢囊肿是否影响胎儿，要根据具体的情况而定。

如果卵巢囊肿比较小，不会影响胎儿的。但是如果卵巢囊肿比较大，容易挤压增大的子宫，容易导致流产、胚胎停育。如果卵巢囊肿发生蒂扭转、出现腹痛，需要急诊手术，麻醉的过程中有可能会影响胎儿。如果行卵巢囊肿剥除会导致卵巢的分泌功能下降，会引起黄体功能不全，也会导致流产现象。

刚刚怀孕的时候发现有卵巢囊肿，其实很多是一种生理性的囊肿，是因为怀孕以后体内激素水平升高，刺激卵巢产生的黄素囊肿。这种情况一般是不会影响胎儿的，所以也不要过于担心。