打完腺病毒载体疫苗后出现头疼症状，考虑以下两种情况所致：

1.正常的生理性反应。一般头疼症状比较轻微，大约接种疫苗后三天恢复，一般不会超过一周。主要是由于腺病毒载体疫苗接种后，机体在吸收过程中释放了一定的热量所致。建议多注意保暖、多休息，尽量不要外出，以免症状加重。

2.考虑是因为接种疫苗后出现的过敏反应。一般头疼症状比较严重，影响了正常的睡眠，同时伴有恶心、呕吐、心慌或者皮肤丘疹样改变等。建议立即遵医嘱给予抗过敏治疗，改善头疼症状。