小儿亚急性骨髓炎主要是因为在急性骨髓炎治疗过程当中没有完全治愈，产生了局限性的脓肿或者骨组织的破坏，该种疾病主要的治疗原则是给予抗菌治疗。

考虑到该种疾病大多数的病原微生物是金黄色葡萄球菌，但是在病原菌未完全明确的情况下，可以选择广谱的抗生素治疗，对于不同细菌的感染有一定的治疗效果。如果已经做了细菌的培养以及药物的敏感试验，可以使用敏感的抗生素治疗，有利于症状的缓解。

部分患者有可能还需要联合使用两种或两种以上的抗生素治疗，具体药物的用法、用量根据医嘱执行。