女性40岁月经量少、发黑，原因主要如下：

1.下丘-脑垂体功能下降。受情绪低落、病理性疾病以及环境因素等影响，让垂体功能开始衰退、降低，也可能对月经造成影响，出现量少、发黑现象。

2.子宫内膜损伤。如女性有过刮宫或者是人流史，让子宫内膜受到损伤不能够得到修复和再生，出现宫腔粘连也会导致月经发黑、量少情况。

3.妇科疾病。卵巢发育不全、子宫内膜结核等疾病，让女性激素水平、子宫内膜等受到影响，也是可能伴随月经量少、月经发黑等症状。