肝移植术后需要长期的使用免疫抑制剂。目前大多采用以钙调节、神经磷酸酶抑制剂为主的联合飘零合成抑制剂，还有激素的三联免疫抑制方案。在感染及肾功能损伤的情况下，需要调整免疫抑制剂的治疗方案。肝移植受者，在发生术后感染时应及时降低免疫抑制强度改联合用药为单一用药。在感染严重的情况下，可以完全停用，但感染控制后需要及时的恢复用药。免疫制剂预防了肝移植受者的这个排斥反应，提高了患者的存活率的同时，也使患者的免疫系统长期的处于抑制状态。有报道的一个新发肿瘤已成为器官移植患者远期死亡的重要原因之一。