灌肠会不会对宝宝肠道有损伤，取决于医生的操作手法以及对该技术掌握的熟练程度，同时也与灌肠使用的药物有一定关系。

假如在灌肠的过程当中，医生、护士比较熟练地使用了这种方法，并且没有使用暴力，一般对宝宝的肠道很少有损伤。如果使用暴力，有可能会导致患者出现肠道出血、大便失禁或者是肠穿孔的可能。

此时需要立即到医院就诊，并且明确具体的部位，必要时还可能需要通过手术治疗缓解症状，具体的手术方式、手术路径根据个人情况决定。