心房颤动可以引起多种并发症。可以诱发心绞痛的发生，是由于心脏的射血减少，从而导致的冠状动脉供血量不足。

可以引起原有的心血管疾病加重，会并发其他心律失常；房颤还可以导致心肌发生病理性改变，导致收缩力减弱，诱发充血性心力衰竭。

房颤可以导致心室出现附壁血栓，诱发体循环栓塞。血栓形成后，一旦脱落还会引起急性心肌梗塞、脑栓塞、下肢动脉栓塞、肠系膜动脉栓塞以及肺栓塞等。