小腿内侧骨头疼痛的原因可以概括如下：

1.由于外力损伤、过度劳累等因素影响，导致患处的肌肉、筋膜发生劳损引起的疼痛，需要注意做好保护，及时休息缓解症状。

2.小腿骨头两侧发生感染炎症，刺激到筋膜后引起筋膜炎，会导致疼痛症状。另外，如果机体缺钙，也会导致小腿出现疼痛。

3.可能患有骨肿瘤引起的疼痛，需要通过完善相关检查后诊断。

当小腿出现疼痛后，如果没有外伤的前提下，可以先进行充分的休息。如果疼痛症状不能缓解要及时就医检查，明确诊断，诊断具体的病因后对因、对症进行治疗。