儿童鼻窦炎与支原体感染的主要区别在于症状表现和病因等方面有所不同。

儿童鼻窦炎主要表现为头痛、鼻塞、发热、咳嗽、流黄鼻涕、嗅觉减退等。一般是由于腺样体肥大或者感染引起的，在治疗缓解后，还可能会出现反复发作的情况；支原体属于一种微小的生物，大部分是无害的，有些患者在感染后没有任何症状，但是有些患者感染肺炎支原体、人型支原体等可能会出现恶心、呕吐、嗜睡、头晕、腹泻、咳嗽、浑身乏力等症状，严重者还可能会引起反复高热。

如果不确定具体原因，可以及时就医，在医生的指导下完善相关检查，明确具体病因。