慢性精囊炎的治疗时间比较长，除了药物之外还需其他治疗。抗生素的选择一般选用脂溶性的药物，比如阿奇霉素和喹诺酮类药物，一般用药时间在1~3个月。

性活动可以增加精囊腺的充血状态，所以应尽量避免性刺激，此时可以应用抗雄激素药物来减轻精囊的充血水肿，此外5阿尔法还原酶抑制剂对于顽固性血精的患者有较好的疗效。对于比较难治的顽固性慢性精囊炎，可以经导管向精囊内注入抗生素保留治疗。

除了药物治疗之外，还可以通过温水坐浴、理疗等方法来促进精囊炎的恢复。